Problemas con aplicaciones e iconos

Buen día.

Hace 1 semana aproximadamente se me borraron los accesos directos de la barra de tareas y del escritorio pero en panel de control seguían los programas, lo que hice fue buscar en la carpeta raiz de cada programa y enviarlos como acceso directo, en algunas aplicaciones si toco reinstalar nuevamente ¿saben si fue alguna actualización o algún tipo de virus?

Saludos.
 
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