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No sé con qué bases de datos trabajas, pero imagino que lo que te digo servirá para cualquiera de ellas. Existe la posibilidad de hacer lo siguiente. En cada uno de los mappings, cuando preparas el Workflow para su ejecución contra el origen y destino de datos, utilizas una conexión ODBC o...

Hola Victor. Herramientas ETL en el mercado existen muchas y de variadas ofertas. Mi recomendación, es que busques la que más te aporte en tu proyecto y sobre todo, no descuides lo que te puedas necesitar y la herramienta pueda aportarte en el futuro. Yo te recomendaría que mirases...